黄河流域生态系统是一个有机整体，但上、中、下游生态环境、经济发展又有着明显差异。因此，加强黄河流域生态保护，必须考虑上、中、下游各自的差异，各地也根据实际情况，有针对性地因地施策。

       上游要以三江源、祁连山、甘南黄河上游水源涵养区等为重点，推进实施一批重大生态保护修复和建设工程，提升水源涵养能力。青海作为黄河的发源地，近些年来加强种植植被、修复生态。当地人发现，草更绿了，水更清了，黄河里的泥沙也少了。
       黄河中游水土流失严重，汾河等支流污染问题突出，因此，中游地区要突出抓好水土保持和污染治理。对汾河等污染严重的支流，则要下大气力推进治理。近日，山西省出台了《山西省黄河（汾河）流域水污染治理攻坚方案》，通过实施22条具体措施，力争在2020年年底前黄河流域国考断面全面消除劣Ⅴ类，促进黄河（汾河）流域水环境质量改善。
       陕北黄土高原丘陵沟壑区是入黄泥沙主要来源区。多年来，陕西深入实施退耕还林还草、天然林保护、三北防护林建设等工程，累计退耕还林还草4039万亩，治理沙化土地1570万亩，年均入黄泥沙量由8.3亿吨减少到2.68亿吨。
       下游的黄河三角洲则要做好保护工作，促进河流生态系统健康，提高生物多样性。作为黄河入海的地方，山东省东营市全力实施黄河三角洲大保护，加强自然保护区管理，先后修复湿地2.3万公顷。